关于坐禅的方法，《大比丘三千威仪》卷上指出，应该四时随时坐禅，有能够舒适的床坐，有柔软的坐垫，有安静的空闲处，有一起修行的善知识；另外，还需要无所求的好护法，能够提供饮食、医药等供养。这些，都是外在的条件，修行者自身应该善于观察自己的思想，能够调伏自己的身心等。此外，智在《修习止观坐禅法要》、《释禅波罗蜜次第法门》等书中，对坐禅方法也颇多论述。日本、朝鲜佛教界，对于坐禅也都十分看重。
中国禅宗对于坐禅方法与时间等相关事项，也有很多规定。如《敕修百丈清规》卷五《大众章》“坐禅仪条”对坐禅方法记载非常详细。禅林中，上堂以前于僧堂坐禅少时，称为“坐堂”。小参之前及每日晚参之前，于僧堂坐禅少时，称为“坐参”。定式坐禅之后再坐者，称为“再请禅”。得法的住持，为勉励大众而伴随大众的坐禅，称为“伴禅”或“陪禅”。
对于坐禅的时间，一般讲究“四时坐禅”，即一日之中四次定时坐禅。《永平清规·辨道法》，以黄昏（下午八时）、后夜（凌晨二时）、早晨（上午十时）、晡时（下午四时）之坐禅称为“四时坐禅”。北宋《禅苑清规》中并未记载有“四时坐禅”的说法。但是，为了能够集中精力，克期求证，修行者必须经常做限期的修行。在一定时期内，除了必要的饮食睡眠之外，专心致志地坐禅。通常大多以7日为单位，称为“禅七”。禅七的时间是以7天为一个七，最长时间达到七七四十九天。禅七最早起源于何时，目前尚不清楚。但是，在明代戒显《禅门锻炼说》记载：“欲期克日成功，则非立限打七不可。立限起七，不独健武英灵，奋迅百倍。即懦夫弱人，一求入保社而心必死，亦肯捐身而舍命矣！故七不可以不限也。”这就是指“禅七”。估计在宋元时期，禅林可能已经出现了“禅七”。扬州高寺、西安卧龙寺、江西云居山真如寺每年冬天都在举行“禅七”。一般由方丈、首座，或杰出的云水僧主持，称为“主七”。禅七的目的是要使修行者在经历睡眠缺乏的折磨及参话头的挫折后，克期取证。在长达49天的7期禅七中，禅僧只能在吃饭、一个礼拜一次的沐浴时间，离开禅堂。其余时间，都在禅堂内坐禅、跑香、止静等。
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